Thèses soutenues à Paris : Pour la médecine, les thèses sont conservées depuis 1539. Consulter le catalogue Baron pour la période 1539-1791 et le catalogue Noé Legrand pour la période 1763-1778 avec un prolongement de 1778 à 1793. Consulter également le fichier des thèses tenu à jour dans la salle de lecture. Depuis la création de l'Ecole de Santé, toutes les thèses soutenues à Paris sont conservées à la Bibliothèque. Il s'y ajoute les thèses vétérinaires, celles de chirurgie dentaire et les mémoires d'orthophonie. -- Pour la chirurgie, consulter les deux collections Pierre Sue (4 volumes de thèses soutenues au collège de chirurgie, de 1749 à 1789) et Arrachart (5 volumes concernant la même période 1749-1789).
Thèses soutenues en province : jusqu'au XIXe siècle il n'existe en France que trois facultés de médecine qui sont celles de Paris, Strasbourg, et Montpellier. La Bibliothèque possède une collection assez complète des thèses anciennes de Montpellier et de Strasbourg et toutes les thèses soutenues dans les facultés de médecine de province au XIXe et XXe siècles. Manquent toutefois les thèses dactylographiées soutenues en province pendant la Deuxième guerre mondiale.
Thèses soutenues à l'étranger : Collection très importante et très ancienne. Peut concerner des Français qui ont fait leur thèse à l'étranger, notamment pour l'Alsace-Lorraine entre 1871 et 1919.
Sous-série F8 (Police sanitaire).
Médecins, pharmaciens, officiers de santé, an XI-1821 (listes de noms, classement départemental) : F8 142 à 148. -- Inventeurs de remèdes et d'art de guérir (dossiers individuels classés alphabétiquement), début XIXe s.- 1913 : F8 149 à 167 et 242 à 251.
Sous-série F12 (Commerce et Industrie).
Légion d'honneur accordée à des médecins des services d'hygiène rattachés au ministère de l'Intérieur (dossiers individuels de propositions), 1815-1916 : F12 5080 à 5300.
Sous-série F17 (Instruction publique).
Médecine, registres des gradués, 1809-1850 : F17* 2364 à 2367. [Ces registres donnent les nom, prénoms, date et lieu de naissance, académie dans laquelle les gradués ont obtenu le certificat d'aptitude, dates de ce dernier et du diplôme délivré par le Grand Maître de l'Université. Classement chronologique. Complet jusqu'en août 1810. Très irrégulier ensuite. Au minimum, comporte nom, académie dans laquelle le gradué a obtenu le certificat d'aptitude et la date du diplôme délivré par le Grand Maître.].
Pharmacie, registres des gradués, 1818-1820 : F17* 2417 [ordre alphabétique avec nom, prénoms, faculté et date du diplôme] ; 1842-1850 : F17* 2384 [mêmes renseignements que ci-dessus pour la médecine]. Classement chronologique.
Médecine, répertoires et diplômes, 1854-1862 et 1863-1869 : F17* 2392 et 2393 [avec renseignements minimums] ; 1869-1873 : F17* 2394 [comprend nom, prénoms, lieu et date de naissance, date du diplôme]. Classement chronologique.
Pharmacie, répertoires et diplômes, 1854-1869 : F17* 2405 et 2406 (classement chronologique).
Jurys médicaux, an XI-1854, Paris : F17 2386 ; Montpellier : F17 2387 et 2388 ; Mayence, Strasbourg, Turin : F17 2389. [Donnent, par départements, la liste des médecins et chirurgiens proposés pour former les jurys médicaux avec nom, prénoms, âge, époque et lieu de réception, fonctions remplies par les membres du jury ; donnent aussi de façon irrégulière, les procès-verbaux des opérations des jurys médicaux.] -- Officiers de santé, pharmaciens, herboristes, sages-femmes reçus chaque année, an XI-1854 : F17 2391 à 2454. [Donnent nom, prénoms, diplôme ou certificat obtenu ; classement départemental par jury médical.].
Affaires médicales, inventions, découvertes, 1830-1895 environ : F17 2387 à 3691.
Collège de France, Chaires de médecine, an XII-1934 : F17 13555.
Agrégation de la faculté de médecine, 1878-1913 : F17 4462 à 4466.
Académie de médecine, 1789-1897 : F17 3679 à 3701.
Muséum, chaires, XIXe-XXe s. : F17 13566.
Thèses soutenues devant les facultés de médecine de Montpellier, Nancy, Paris et Strasbourg, 1865-1880 : F17 4472 et 4473.
Personnel médical, 1803-1926 : F17 4511 à 4556. Notamment : médecins étrangers, 1803-1865 : F17 4513 à 4523 (classement alphabétique) ; officiers de santé, 1833-1846 : F17 4524 à 4530 ; pharmaciens, 1833-1846 : F17 4531 à 4534 ; listes des médecins, officiers de santé, dentistes et sages-femmes exerçant dans les départements (classement départemental), 1853-1926 : F17 4541 à 45562.
Certificats d'aptitude (donnent, nom, prénoms, date de naissance et, pour les médecins, le sujet de thèse) : docteurs en médecine, 1810-1905 : F17 6084 à 6469 ; officiers de santé, 1855-1905 : F17 6470 à 6489 ; chirurgiens, dentistes, 1894-1905 : F17 6490 à 6494 ; pharmaciens de 1ère classe, 1854-1905 : F17 6495 à 6525 ; pharmaciens de 2ème classe, 1842-1881 : F17 6526 à 6570. La série des certificats d'aptitude est complète, mais dépourvue de répertoire.
Sous série AJ16 (Ecole puis Faculté de Médecine de Paris).
Registres d'inscriptions des étudiants (comportant nom, prénoms, lieu et date de naissance, adresse à Paris), an IV-1839 : AJ16 6411 à 6451 ; 1920-1946 : AJ16 6452 à 6487. La période 1840-1919 n'a malheureusement pas été retrouvée.
Dossiers du personnel enseignant et du personnel administratif (tous dossiers confondus), 1790-1953 : AJ16 6499 à 6524.
Dossiers des étudiants en médecine : une soixantaine de liasses. Donnent les noms, prénoms, date et lieu de naissance ou âge, département d'origine, scolarité, sujet de thèse, nom des examinateurs, date de soutenance. Concernent tous les étudiants de 1806 à 1871 et, en outre, les années 1894, 1895, 1897, 1903 et 1904. Le fichier correspondant (16 000 fiches) est à consulter aux Archives de la Faculté de Médecine (12, rue de l'Ecole de Médecine, 75270 paris). Il donne les nom, prénoms, date et lieu de naissance, sujet et année de la thèse (classement par ordre alphabétique). [Les dossiers d'étudiants postérieurs aux dates indiquées ci-dessus sont conservés aux Archives de la Faculté de Médecine].