Elle est inaugurée le 15 août 1860. Elle fait l'objet d'une inscription au titre des monuments historiques depuis le 16 mars 1926<ref>[http://www.culture.gouv.fr/public/mistral/merimee_fr?ACTION=CHERCHER&FIELD_1=REF&VALUE_1=PA00088520 Notice sur la base Mérimée]</ref>.
Une ancienne fontaine Saint-Michel existait sur l'ancienne [[Place Saint-Michel (ancienne)|place Saint-Michel]], présente sur le plan des fontaines de Paris de [[Jean Delagrive |Delagrive]] de 1737.